在 D 版发过了，不过因为不少朋友看不到 D 版，我就放在这里吧，说说我最近做的这个 Project
coolwulf · 2018-06-13 05:39:11 +08:00 · 43368 次点击这是一个创建于 2360 天前的主题，其中的信息可能已经有所发展或是发生改变。
去年的时候，我一个在芝加哥比我小几级的南京大学校友去世了。乳腺癌，发现得晚了，才 34 岁，留下了一个 4 岁的孩子。非常可惜。想想能不能做点什么事情可以帮助大众来提高乳腺癌的早期检测成功率。因为如果在 stage 1 发现乳腺癌的话，5 年存活率是 99%。
想想能否写一个完全免费的网站和 ios app 来让用户可以迅速得到 X-ray Mammogram 的诊断结果。至少可以是 2nd Opinion. 因为用户做完 Mammography 之后有时候需要等好几天才能有 Radiologist 来读片子。而且现在 Radiologist 有 20% 的概率会漏掉早期的肿瘤。我决定用 Deep Learning (深度学习) 来做这件事情。
对于一个足够好的 Deep Learning Model, 一是要有足够多的数据 (即使是做 Transfer Learning 的情况下), 二是要有足够强大的计算力。为了做成这件事情，我在本地搭建了一个 50 个 Nvidia Geforce GTX 1080 Ti 的 GPU cluster, 这是搭成之后的硬件:
有了硬件之后就是设计 Model 和收集数据。我从北美和欧洲的几个研究组获取了 Annotated Breast Mammo 的数据。这些 Annotation 大多都是根据北美 ABR certified 的 Radiologist 做出的。也就是如果这个 Model 能够训练好，就可以达到 ABR Certified Radiologist 的 Reading 的平均水平或者更好。
最终的结果我在欧洲的 InBreast 数据上做了测试，达到了 90% 的准确度 (AUC).
我觉得这个 Model 已经可以给大众实用了，在这里公开出来:
你可以直接上传 .jpg 形式的 Mammo 图片，这个 AI 会给出判断结果. 这是 Screenshot:
这个网站是完全免费使用的。我现在还在继续更新和改进 Model, 也在联系国内的几家医院来合作来获取更多的数据来 Training.
University of Kentucky Hospital 和国内的一家合作公司已经在测试了这个模型
乳腺癌检查去年有个全世界竞赛，他们先用这个竞赛获得第二名程序测试了 MIAS 数据，漏了 10 个 case, 然后他们用我的网站测试了一下，只漏了一个
这个第二名程序发表了一篇自然杂志的论文:
https://www.nature.com/articles/s41598-018-22437-z
这两天，我也公布了完全免费的桌面版本，支持读取和浏览 dicom 文件，并自动转换 Normalize for AI analysis. 在 InBreast 的 Dicom 数据上 AUC （准确率）大概 93%。桌面版本截图:
下载地址就在网页主页上。
[06/12/2018 更新] NeuralRad Mammo AI 桌面版本更新到了 1.2, 修复 dicom/jpg 文件路径有中文或者空格导致无法返回正确结果的问题。依然从主页 http://neuralrad.com 免费下载
第 1 条附言 · 2018-07-18 03:08:25 +08:00
[07/17 更新 桌面版本 1.4]
+ 修复标注的一个 bug
+ 标注保存文件 annotation.txt 保存在图像当前目录下
+ 修复标注的一个 bug
+ 标注保存文件 annotation.txt 保存在图像当前目录下
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Vnaner 2018-06-13 12:37:36 +08:00
支持
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keysona 2018-06-13 12:41:43 +08:00
不知道说什么，只能顶贴。
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xi_lin 2018-06-13 12:43:51 +08:00
给大佬点赞
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hlwjia 2018-06-13 12:44:49 +08:00
that's what i'm talking about
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windfarer 2018-06-13 12:45:00 +08:00 via Android
太 cool 了！点赞
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TonyLiu2ca 2018-06-13 12:49:09 +08:00
好好好
支持 |
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tywtyw2002 2018-06-13 12:54:03 +08:00  5
前几天吃早茶的时候跟朋友聊过这个话题，有几个问题以及疑问吧，我们一直没有讨论出结果。
1. Train model 的时候你用了多少的乳腺癌数据？在北美，这些数据都是要求保密的，需要很大的精力才可以拿到，而且价格很贵。我朋友她老板，用了很久也没有找到他认为足够多，而且足够好的数据。（ X-ray Mammography ） 2. 伦理问题，Mammography 在线检测的性质是什么？是一个帮助 Doctor 去做诊断的程序，还是仅仅用来去筛选出良性 X 光片去帮助 Doctor 节约时间？ 不管是什么性质的程序，是否让大家随意检测会加深患者的心理负担呢？我一个研究医学影像的朋友提出了一个问题，如果医生的诊断和 AI 的诊断相反，那么应该如何去进行判断？ 3. 关于 Future 的一个问题。未来，AI 在医学诊断的地位应该是什么样子的呢？ |
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deepSeaCode 2018-06-13 12:55:42 +08:00
点赞，支持大佬
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Lothar 2018-06-13 12:59:44 +08:00
支持大佬
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TonyLiu2ca 2018-06-13 13:04:58 +08:00
觉得楼主的算法还是在自己手里，下载的软件只是前端，计算过程还是在它搭建的计算环境中，客户端软件最后将返回的结果呈献给用户而已。所以不存在用户软件泄密算法和知识库的情况。
不过，有了利益驱动后，小心黑客的渗透和攻击。估计你这方面就不太专业了，所以还是要尽量小心。 |
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SakuraKuma 2018-06-13 13:05:36 +08:00
支持大佬，比起挖矿，这才是正确的使用方式。。
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fiht 2018-06-13 13:06:00 +08:00
卧虎藏龙的 v 站
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myliyifei 2018-06-13 13:11:24 +08:00 via Android
@codingadog 为什么，非法行医？
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raofeng 2018-06-13 13:13:45 +08:00
牛啊，必须支持。
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sm0king 2018-06-13 13:16:30 +08:00
这种帖子，一定要顶，还有什么可说的！
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openroc 2018-06-13 13:19:32 +08:00
赞。👍。
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Exin 2018-06-13 13:23:31 +08:00
能力越大责任越大，楼主这样的大牛是真正地在推动世界进步，敬佩！
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tutustream 2018-06-13 13:25:26 +08:00
大牛推进社会进步
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irainsoft 2018-06-13 13:28:29 +08:00
厉害，点赞，这真的是科技推动人类进步了。
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szluohb 2018-06-13 13:31:39 +08:00
赞一个
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caijunyi 2018-06-13 13:32:59 +08:00
这个是真要顶起来！
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AaronWang13 2018-06-13 13:36:07 +08:00
顶贴
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BobMinions 2018-06-13 13:38:08 +08:00
大佬这个项目 惠及大众 牛
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skadi 2018-06-13 13:41:55 +08:00
啊\支持!!!
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WLW 2018-06-13 13:46:38 +08:00
来自 D 版带着爱，感恩楼主
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duowb 2018-06-13 13:47:34 +08:00
支持！！！
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nasmatic 2018-06-13 13:50:03 +08:00
在一众娱乐 app 产品面前，看见这个觉得很棒
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Tink 2018-06-13 13:51:25 +08:00 via iPhone
确实厉害👍佩服佩服
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shawngao 2018-06-13 13:53:22 +08:00
厉害
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yogogo 2018-06-13 13:58:31 +08:00 1
真·大佬，能否分享下楼主的学习路线
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aoaione 2018-06-13 14:04:25 +08:00
支持
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doomgiant 2018-06-13 14:09:39 +08:00
真大佬，厉害
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Autumn00123 2018-06-13 14:09:49 +08:00
厉害！
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rockdodos 2018-06-13 14:11:51 +08:00
真大佬支持支持
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OrangeM21 2018-06-13 14:12:13 +08:00
真丶大佬 给跪
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rayang2004 2018-06-13 14:13:52 +08:00
赞个堡主
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RyuZheng 2018-06-13 14:17:24 +08:00
@tywtyw2002 #107 第二个问题，我的观点，类似现在的基因检测，作为辅助诊断，不能下临床决策，一切以临床诊断为准
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missyoudu 2018-06-13 14:17:44 +08:00
支持一下！技术改变生活
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CarpeDiemmm 2018-06-13 14:22:38 +08:00
给大佬点赞 mark 一下
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ballshapesdsd 2018-06-13 14:23:08 +08:00
50 条 1080ti，好有钱
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alikesi 2018-06-13 14:29:35 +08:00
佩服!
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silencefent 2018-06-13 14:32:27 +08:00
@ballshapesdsd 训练数据比设备值钱了解一下
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xiaojunjor 2018-06-13 14:43:28 +08:00
这个厉害，我辈楷模，学习榜样
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Jak 2018-06-13 14:51:28 +08:00
点赞！
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silentstar 2018-06-13 14:59:24 +08:00
厉害呀~~~
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ResidualWind 2018-06-13 15:01:16 +08:00
点赞，支持大佬
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whileFalse 2018-06-13 15:02:52 +08:00
大佬有钱。为啥考虑自己搭建不用云呢？
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tywtyw2002 2018-06-13 15:09:14 +08:00
@RyuZheng #137 如果只作为“辅助诊断”那么有必要去花精力去提升准确度吗？ 这个未来会是个头疼的话题。
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RyuZheng 2018-06-13 15:11:34 +08:00
@tywtyw2002 #149 那当然有，一开始作为辅助诊断，慢慢提高准确度和易用性，就会成为“金标准”；每项新检测手段出来时都应该是这样的演变过来。
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hiyouli 2018-06-13 15:12:39 +08:00
这才是我们应该做的事情，可惜的是我们还在拼命为生计而奔波。
——出自不知道谁说的。 |
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jswh 2018-06-13 15:28:28 +08:00
向你致敬和学习，程序员真的能改变世界
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Kintkintkint 2018-06-13 15:30:16 +08:00
给大佬点赞
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onepunch 2018-06-13 15:31:21 +08:00
给大佬点赞👍
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CloudnuY 2018-06-13 15:33:14 +08:00
d=====(￣▽￣*)b 厉害
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crll 2018-06-13 15:44:15 +08:00
给大佬点赞!!!!!!
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romanroad6 2018-06-13 15:51:02 +08:00
给大佬点赞！
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wwyy456258 2018-06-13 15:58:26 +08:00
给大佬点赞，好人！
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liguoqinjim 2018-06-13 16:00:49 +08:00
这是我想成为的那种程序员，赞！
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xcc880 2018-06-13 16:03:58 +08:00
👍!
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orangeade 2018-06-13 16:11:09 +08:00 via Android
厉害
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claymore94 2018-06-13 16:16:02 +08:00
厉害厉害 这才是程序应该有的样子
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zhangchioulin 2018-06-13 16:21:14 +08:00
敬佩
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lguan 2018-06-13 16:23:52 +08:00
精品来的为堡主点个赞
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fengtalk 2018-06-13 16:31:17 +08:00
厉害厉害，为楼主点赞！
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Sxx1314 2018-06-13 16:46:25 +08:00
点赞 这才是 gpu 编程最佳的使用方式啊 看得我也想把四张 7990 升级成 1080ti 了
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coffeedeveloper 2018-06-13 16:47:55 +08:00
真的点赞
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hzw94 2018-06-13 16:58:03 +08:00
真大佬
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LongCT 2018-06-13 17:00:53 +08:00
跪了。
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814517669 2018-06-13 17:06:50 +08:00
大佬厉害了
为毛我只能用显卡吃鸡？ emmmm |
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jack991 2018-06-13 17:13:06 +08:00
厉害，，支持楼主。。。致敬
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eliteYang 2018-06-13 17:18:18 +08:00
强烈支持
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falcon05 2018-06-13 17:27:08 +08:00 via iPhone
不明觉厉
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ChangQin 2018-06-13 17:33:04 +08:00
给大佬点赞!!!!!!
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AllenW 2018-06-13 17:33:47 +08:00
给大佬点赞
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zhang1215 2018-06-13 17:34:28 +08:00
希望 V 站天天都是这种帖子
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roytam1 2018-06-13 17:35:22 +08:00
大佬有想過把 KMCCF 的源碼放出來嗎
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Jaeger 2018-06-13 17:37:54 +08:00
与百度莆田系形成鲜明对比！
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WeaPoon 2018-06-13 17:48:10 +08:00
同学的妈妈和一个阿姨也是这个疾病过世的．
帮你顶下． |
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cosmic 2018-06-13 17:58:01 +08:00
给学长点个赞！
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lavender1991 2018-06-13 18:09:47 +08:00
支持大佬，这才是真正的技术人
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fcj558 2018-06-13 18:11:02 +08:00 via iPhone
厉害了，楼主！
来自 D 版带着爱～ |
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YzSama 2018-06-13 18:30:48 +08:00
真大佬。。。支持你
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564425833 2018-06-13 18:32:05 +08:00
you are so cool
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feder 2018-06-13 18:42:38 +08:00
跨界大佬才是真大佬，赞
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doppler 2018-06-13 18:48:43 +08:00
👍
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dwlinux 2018-06-13 19:01:20 +08:00 via iPhone
大佬厉害， 必须赞👍
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evanvane 2018-06-13 19:19:04 +08:00 1
楼主能否不要用 scientific reports （尽管是 nature 下的）来混淆 nature 啊？
不知道是不懂还是故意为之，反正我是激动着点进去一脸懵逼的关掉页面的 |
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ieliwb 2018-06-13 19:30:14 +08:00
厉害了，赞一个。
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SquirrelMAN 2018-06-13 19:36:36 +08:00
向大佬学习
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liyuanji1002 2018-06-13 19:36:49 +08:00
实在是太了不起了! 越来越想让自己变成有钱人了.
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admin010 2018-06-13 20:16:49 +08:00
D 版带着爱
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weyou 2018-06-13 20:20:35 +08:00 via Android
赞，还是免费的
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Damaidaner 2018-06-13 20:33:37 +08:00 via Android
还能说什么呢？ LZ 大赞！
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mengyaoss77 2018-06-13 20:41:42 +08:00 via Android
厉害
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itbeihe 2018-06-13 20:48:39 +08:00
给大佬点赞
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armysheng 2018-06-13 20:55:15 +08:00
研究生阶段做的是超声肝脏图像的识别分类，当时想用深度学习做，后来发现啥资源都没有。。。
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rookiebulls 2018-06-13 20:56:56 +08:00 via iPhone
膜拜大神
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199
linxy 2018-06-13 21:24:57 +08:00
牛逼！！
感谢有你 |
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200
est 2018-06-13 21:45:10 +08:00
50 个 gtx 1080ti 集群。。6666
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